2006年度按在国际上发表论文被引用篇数排名前十的高校依次为：清华大学（3129篇）、北京大学（2916篇）、浙江大学（2692篇）、中国科学技术大学（2333篇）、南京大学（2239篇）、复旦大学（1914篇）、上海交通大学（1963篇）、吉林大学（1244篇）、武汉大学（1232篇）、山东大学（1191篇）。

　　2006年度被SCI收录论文数排名前十的高校依次为：浙江大学（3034篇）、清华大学（2901篇）、上海交通大学（2243篇）、北京大学（1957篇）、复旦大学（1590篇）、中国科学技术大学（1559篇）、南京大学（1414篇）、吉林大学（1126篇）、华中科技大学（1107篇）、武汉大学（1107篇）、山东大学（1059篇），其中华中科技大学和武汉大学并列第九。

　　2006年度被工程索引（EI）收录论文数排名前十的高校依次为：清华大学（3317篇）、上海交通大学（2926篇）、浙江大学（2760篇）、哈尔滨工业大学（2137篇）、天津大学（1653篇）、华中科技大学（1362篇）、中国科学技术大学（1264篇）、西安交通大学（1240篇）、大连理工大学（1166篇）、西北工业大学（999篇）。

　　2006年中国在国际社会科学期刊上发表10篇以上论文的单位有9个，依次是：北京大学（70篇）、清华大学（32篇）、北京师范大学（29篇）、浙江大学（20篇）、西安交通大学（14篇）、复旦大学（12篇）、武汉大学（10篇）、中南大学（10篇）、中国社会科学院（10篇）。