国家863计划现代农业技术领域进一步完善了水稻和家蚕的功能基因组研究技术平台，在保持我国基因组研究国际地位的同时，提升了竞争能力。

　　我国在国际上较早地启动了水稻功能基因组研究项目，“十一五”期间继续大规模开展水稻功能基因组研究，完善已创建的水稻大型突变体库，建立了水稻全生育期、逆境、低氮、低磷等条件胁迫的全基因组表达谱，成功研制出水稻全基因组的覆瓦式（Tiling）芯片，进一步提升我国水稻功能基因组研究的整体水平和国际地位，使我国水稻功能基因组研究在国际上形成了明显优势。同时作为植物基因组研究的模式植物，水稻功能基因组研究平台的完善将带动其它作物如小麦、玉米、棉花、油菜、大豆、花生等作物的功能基因组研究，全面提升我国在作物基因组和遗传改良领域的创新能力，为农作物品种遗传改良提供技术储备和基因资源。

　　在“十五”家蚕功能基因组研究平台的基础上，成功设计并制作了世界上第一张家蚕的全基因组oligo芯片，共包括22987条基因探针。利用芯片对5龄3天家蚕的精巢、卵巢、丝腺（前中部丝腺、后部丝腺）、表皮、血液、马氏管、中肠、脂肪体进行了表达谱分析，初步发现了一些与吐丝、免疫防御、变态发育等过程有关的起重要作用的基因，这些基因的发现为进一步分析家蚕性别决定、抗性、丝蛋白合成等重要性状相关的功能基因提供了重要信息。同时，基本建成了收集数据最多、各种检索功能齐备的家蚕功能基因组研究信息平台。初步建立了以piggyBAC转座子为载体、显微注射为手段，各种化性品种为受体的高效家蚕转基因技术体系，为家蚕功能基因组研究和家蚕育种材料创新打下了良好的基础。